当时的朱温正在东渭桥屯驻，而诸葛爽带着大军还在栎阳，于是黄巢就让朱温去说服诸葛爽投降。这一次事件，也是大多数史书中第一次记录朱温的一件史实。朱温出马，那肯定是马到成功，诸葛爽爽爽利利的投降了。
而就在黄巢登基大封群臣的时候，凤翔节度使郑畋则召集各道兵马。还有留在关中的禁军准备讨伐黄巢。
十二月十八日，唐僖宗到了兴元，向天下诸道发布诏令，命令诸路军队收复长安。
中和元年881年二月，黄巢任命朱温为东南面行营都虞候进攻邓州，想要加强长安东面的守备力量。
三月初三，顺利攻下邓州，此时朱温一路凯歌。但是另一方面黄巢准备进攻凤翔的五万大军，却遭到了惨败，被凤翔节度使郑畋在龙尾坡击败，伏尸两万，损失惨重。
三月中旬，郑畋趁热打铁传令天下，号召合军攻打黄巢，一时间天下各道军队纷纷响应。黄巢也是个聪明人，他知道进攻西面的时机已经失去了。此时要是调拨大军进攻长安西面，那么长安的相对空虚，就可能给其他的勤王军队提供一个机会。
就算是黄巢全力进攻，但是士气不高，能不能拿下凤翔还不确定的。而如果打凤翔，长安就有丢掉的风险，这是黄巢无论如何不能接受的。权衡利弊，黄巢决定收缩兵力不再进攻长安以西的地方，进行适度的战略收缩。
此后，战事发展对于黄巢越来越不利。四月初五，黄巢决定撤出长安，之后唐军大规模进入，正式接管长安。但是长安的百姓没想到，刚刚赶走了一只老虎，却迎来了一大群狼。这些唐军到了长安，和黄巢的军队没有什么两样，一样的烧杀抢掠。
而此时黄巢的大军在霸上，距离长安不过二十五里。夜里探子传来消息，听说长安城乱了，他知道他的机会来了。二话不说，带着大军又回来了，此时那些唐军哪里还有战斗力（都忙着杀人放火、抢劫敛财），被黄巢打的那是落花流水春去也！（黄巢这一次放弃长安，有人说这是战略性抉择。这件事和后来黄巢杀个回马枪，都是提前谋划好的，唐军是中计了。而且我们通过看整件事情的发展，的确是有这个可能。但这类不同观点，我觉的简单介绍一下就可以了，感兴趣的可以继续深入发掘）。
甚至还有些唐军抢的东西太多了，跑不动！被黄巢的大军抓住然后杀掉。就这样，像是一出闹剧一般，黄巢重新掌握了长安，然后疯狂纵兵屠虐。报复唐军和长安的百姓。
此后各路军队一看得不到什么好处，纷纷返回。黄巢声势更为强大，而就在之前黄巢放弃长安的事件中，朱温也用行动支持黄巢。
当时朱温占据邓州，而黄巢任命的同州刺史、华州刺史、商州刺史听说黄巢弃城而逃，竟然也弃城而逃，投奔朱温，朱温一看，根本不给他们辩解的机会。一个擅离职守图谋背叛大齐的罪名就将这三人抓了起来。
恰好此时黄巢回到长安的消息传来，朱温干净利落的杀死了同州刺史、华州刺史。因为之前朱温路过商州的时候，商州刺史接待他非常好，两人之间总归是有点感情。所以朱温就放了商州刺史，继续让他带着他的军队回到商州小心防守。
后来他对黄巢报告的时候，对商州刺史进行了开脱，最终免于一死。由此可见，朱温也并不是一味的凶狠残暴。要是没点特点，没点能力和情商，想在唐末混下去，是十分不容易的。
六月份朱温回到了长安。虽然这一次朱温是败退回来的（杨复光联合几个藩镇攻克邓州，赶跑了朱温）。但就算是这样黄巢还是亲自到灞上迎接朱温，给予了非常高的礼遇。此时的朱温已经成为了黄巢手下的大将，同时也是黄巢的爱将。当然这和当时黄巢的情况是分不开的。
当时黄巢被各路勤王大军步步紧逼，形势已经相当的严峻了，此时朱温的归来，不仅仅是他一个人回来，而是一支久经沙场的生力军，虽然这只军队人数非常少，而且刚刚打了败仗，但是还是有战斗力的。俗话说千军易得一将难求，对于义军来说能活下来的老兵也是好宝贝。自然要好好的笼络一番。所以亲自出城迎接朱温也就不足为奇了。
当年七月，朱温就接到了任务。当时唐延节度使和权夏州节度使，两人合兵驻扎在东渭桥围困长安，所以黄巢便让朱温带领本部人马把他们赶走。
朱温的作战水平后代评价基本上都是高度肯定的，所以这两个节度使，加一块不过万把人，自然不是朱温的对手，后来八月份黄巢另一位大将也是黄巢大齐政权的宰相尚让也加入了进来（主要工作还是监察朱温，害怕朱温一人独大）。这样一来这两位节度使被打的更是没有还手之力，后来两人看根本不是朱温的对手，而且周围的那些藩镇目测也指望不上，干脆回去吧！不然以后夺取富贵的老本都要折在这里，于是退守富平。
这里要为大家简单的介绍一下当时的情况，当时各路勤王大军，虽然骁勇，而且数量上还不少，但是各自为战，没有统一指挥，不能握紧拳头打人，所以战斗力、战果有限。当时的诸路大军，都是战事有利时各个奋勇争先，生恐落后于人，但是一旦遇挫，各个闭垒自守，互不援救，只求保存各自的有生力量，不求团结歼敌，所以当时的局势一度对于唐军也十分不利，有被各个击破的趋势。
朱温取得此次胜利后，休息了月余，黄巢又命令孟楷和朱温继续扩大战果，进攻退守到富平的唐延节度使和权夏州节度使。
之前刚刚被打败，此时又被朱温袭击，这两处节度的军队自然是斗志不高，更谈不上抗拒反击了，可以说是一触即溃，急忙逃回各自的镇所去了。但是不管怎么说，唐延军和夏州的夏绥军，在之前黄巢刚刚进驻长安的时候，就是最先响应勤王的五藩镇之二，虽然现在被打败了，但是功劳还是不能被抹杀的，所以朝廷赐予夏绥军定难军的称号，唐延军改为保大军。算是抚慰一下他们被朱温深深伤害的心灵！
此次战役之后，黄巢对于朱温自然是更加的倚重，朱温得到的宠信一时无二，而此时黄巢所面临的形势也略微好转。不过虽然朱温得到了黄巢的宠信，但是朱温毕竟是半路出家，所以此时这般受宠，自然引起了一些跟随黄巢起义的那些老人的嫉恨。而这里面最出名的就是孟楷（具体的我们后面会详细说）。
这一次进攻富平的战斗，朱温在指挥作战的过程中，对于孟楷就十分的不屑，朱温有点看不上孟楷。这更加引起了孟楷的反弹。所以在孟楷的心中，渐渐的有了朱温的影子，当然这并不是感情的影子，而是仇恨的阴影，他在等待机会一举发难让朱温死无葬身之地。
时间不知不觉到了中和二年，公元882年，二月。因为之前朱温的出色表现，现在已经成了黄巢的心腹了，再加上出于提高长安城安全系数的的战略需要。于是任命朱温为同州防御使，让他自由攻取同州周边地区。主要是长安东北面，北面等区域。
同州在长安的东北，是长安的一个屏障，只要是同州不出问题，那么长安的东北就是安全的，让朱温执行这么一个重要的任务，可见当时朱温已经成为了黄巢手下独当一面的大将。
而且当时同州一带的情况并不是这么简单的。当初黄巢进入长安，皇帝悄悄的逃命了，根本顾不上大量的禁军。所以城破时，大量的禁军逃到长安的北面和东北，同州这里可以说是抗击官军的最前沿，而且面临的官军实力非常强大。
而朱温既然成了同州防御使（负责一州安全防务的最高军事长官），那么治所自然就是同州，但是朱温的目光可不仅仅放在了同州。
当时朱温的人马是三千人，不算多。但是黄巢全权让他负责，要是利用得好，这何尝不是一个机会，所以朱温从渭北出兵，攻打美原、奉先。又度过洛水，攻下丹州，直逼延州。一下子又把长安北面搞了个“支离破碎”。
虽然只是数千人流动作战，但是转战上千里，战果也是十分显著的。同州北面和西面与唐军的联系彻底隔绝。而在同州的东面是黄河，要是防守的话，那是天险，但是从其他三面被攻击，那黄河就是天然的隔离带，将黄河两岸的唐军隔绝开来，黄河东岸的唐军很难和同州取得联系。而在同州的下面则是华州，此时全部被黄巢的军队占领。所以此时看看同州的情况，我们就可以知道朱温的战略意图，而且这个战略意图也已经可以说完美的实现了，通过这一系列的战役，我们可以稍稍领略一下后梁太祖朱温的战争艺术。
在将同州周围与唐军的联系全部切断后，同州成为了大海中的一处孤岛，在大齐政权的包围下风雨飘摇，勉力维持。
此时同州刺史米诚一看事不可为，这也是个果断的人，虽然有贪生怕死之嫌，但还是立刻弃城而逃，投奔河中王重荣，好歹保住了小命。
于是朱温不费一兵一卒进驻同州。捷报传来，黄巢万分高兴，重重嘉奖朱温，又封朱温为同州刺史，这样一来。朱温集军政大全于一身，可谓是一方大吏，声名渐显，在唐末的江湖里算得上是初露峥嵘了！
不过占据了同州后，这里还发生了一件故事，一件关于朱温还带着点奇幻色彩的爱情故事。