中国古代的城墙出现很早，都是以夯土筑成。由于夯土是一层一层筑成的，因而层次分明，甚至连夯窝都还保留，很容易识别。在尼雅No.2遗址的土丘，看不出夯土的层次，显然不是人工筑成。土丘上部烂泥状的黄土，是由于风蚀作用所致，不是人有意堆积的。况且以烂泥堆积城墙的方法，在中国还没有前例。因此，这两座土丘应是自然形成的结果。在黄土层坚硬的地区，风蚀作用可以塑造各种奇形怪状的地貌，其中有的极像城堡，有风蚀城堡之称。风蚀城墙，也是风蚀作用的一种表现形式。
古代的王城，多是正方形或长方形，四面都有城墙。如果No.2上述土丘是城墙的话，由于它在No.2遗址的南方，应是南城墙。此外，在No.2的东方、西方、北方还应当有城墙，才能组成一个方形或长方形的城池。然而，迄今为止却没有发现东城墙、西城墙、北城墙，这说明No.2南方的土丘是孤立的、偶然的现象，不会是城墙。
再退一步说，如果土丘是城墙，No.2便应当是精绝国的王城。作为王城，国王居住生活之处，必须有华丽的宫殿，雕梁画栋，才能显示出国王至尊的地位。浮雕梁头、柱头的现象，在尼雅的其它房址中屡有发现，然而在No.2却没有发现。又如在No.3的墙壁上有彩色的装饰画，地上发现有彩色地毡的残块，还有浮雕的木椅，显示出房主人有很高的身份；在No.4发现有装饰狮头、马腿、鸟翼的木椅和吉他，也显示了房主人的高贵身份。但是，在No.2房址中除了文书以外，却没有见到这类珍贵的生活器物，这都反映出No.2并不是高贵人士所居住的地方，更不像是国王所居住的王宫所在。
如果我们将尼雅遗址中，比较讲究的房址综合分析，那么，王宫之所在应当具备以下的条件：
房址的规模比较大，应当有十余个房间，各种生活设施比较齐全，大厅、厨房、竖炉等应有尽有；
房间应有华丽的装饰，如彩色壁画，彩色的地毡；
房间内应有浮雕艺术的桌、椅、床等高贵的家俱；
房间内应有金、银、玉装饰品的残迹；
房梁和房柱应有浮雕装饰，有雕梁画栋的气氛；
房址周围应当有凉亭、果园、水塘之类，作为国王散步游玩的场所；
房址应当地处交通方便的地方，距尼雅河不会太远，甚至就在尼雅河边，便于取水用水。
王城可以有土筑的城墙，但是不一定必须要有土筑的城墙。在东北地区，曾有以木栅栏组成的木城。古代尼雅地区森林资源丰富，取之方便，王城也可以是木城，甚至是比较讲究一些的红柳篱笆墙。
尼雅王城在何处？这是一个尚未解决的问题。随着尼雅考察研究的深入进行，这个问题将来是可以解决的。
4.留给人们的思考
尼雅遗址上的古代居民，曾创造了相当高的古代文明。然而现在的尼雅，却沦为没有生命的死亡废墟。这沧海桑田的变化，给每一个进入尼雅考察的人，都提出了一个巨大的问号，这就是尼雅的巨大变化是怎样发生的？尼雅废弃的原因是什么？
有生命的东西，都离不开水。无论是对动物，或植物，都是如此。作为人类来说，对于水的需求，要比其它动物、植物更为迫切。我们不必说现在北京、天津等大城市严重缺水，影响了城市的正常生活，准备实施南水北调的计划，即使是在没有现代工业的古代，人们的衣食住行也需要大量的水。到过沙漠的人都知道，在这里水比其它食物还要重要，死于沙漠的人，大部分是干渴而死的。
古代尼雅人是以农业耕种为生，当时的农业耕种，完全是一种水浇地。没有尼雅河水的灌溉，耕种即无法进行。现在的尼雅遗址范围内，全部都处于干涸状态，见不到一滴水。河流干涸了，森林枯萎了，苍蝇、蚊子、老鼠都见不到了。在这种情况下，人类自然无法生存，要离开这里。因此，尼雅河下游河水的消失、干涸，是引起尼雅文明衰落的基本原因。斯坦因在考察尼雅遗址以后，曾指出尼雅河“河道干涸，三角洲无可置疑的后移，应必然是遗址放弃的直接的或惟一的原因”。斯坦因的看法是很有道理的。
尼雅河的退缩，已经成为千真万确的事实。然而尼雅河的退缩又是什么原因造成的呢？这是需要研究解决的重要问题。
尼雅河同和田河、克里雅河、牙通古孜河、安迪尔河一样，都是发源于南部的昆仑山，由高山冰雪融化所形成。在民丰、于田、策勒、和田之间的315国道上旅行，可以清楚地看见昆仑山上白皑皑的冰雪，它就是这些河流的水源。冰雪融化的多少，直接决定了河流的水量。冰雪融化得多，河水就充足，流程也就越长；冰雪融化得少，河水就贫乏，流程也就随之而短。
昆仑山上冰雪融水的多少，受气温的影响。气温高，雪水就多，气温低，雪水就少。气温的变化，主要是由大气环流决定的，常常出现周期性的变化。据我国著名的气象学家竺可桢的研究，周代的气候比较寒冷，前后持续了一、二百年。到春秋时期，气候又变暖和了，历经战国时期，一直持续到西汉时期。到了东汉时期，气候又转冷，一直持续到魏晋南北朝时期。当时南京出现了冰房，说明相当寒冷。
从春秋到西汉，温暖的气候持续了八百多年。在此期间，冰山积雪自然要大量融化。于是，发源于昆仑山的各河流，呈现河水充足的局面，尼雅河自然也不例外。这是西汉时期尼雅经济昌盛，汉军大肆屯田耕种的重要条件。自东汉气候转冷，但是这种变化要有一段过程，并不是短期内即下降到低谷。由于气候转冷，冰山积雪的融量减少，尼雅河水逐渐萎缩，农业灌溉用水出现了短缺不足，这在尼雅出土的文书中，是有所记载的。由于水源的不足，官府采取了管水、节水的措施。征收水费，就是管水、节水的一种表现。尼雅出土的文书，主要是东汉至魏晋时期的遗物，所记载的缺水，就是这个时期的情况。自此以后，尼雅河水的退缩在不断加剧，最后退缩到现在的大麻扎附近。
有一种看法，认为尼雅文明的衰落，是由于民族间的争斗和战争所引起的。在尼雅出土的文书中，屡见苏毗人威胁的记载。有一件文书称为了防止苏毗人的掠夺，曾将“州邦之百姓安置于城内”；又有一件文书说：“现有众多的苏毗人已到达纳缚县”。有人据此提出，尼雅人是受到苏毗人的威胁，而逃往其它的地方。这种说法有些不近情理，当时的尼雅是在于阗国的管辖之下，于阗国怎么能坐视不救？于阗国在尼雅设立有州县，怎么能允许尼雅人全体逃亡？再说尼雅人世代居住于此，又怎么能轻易地放弃自己的家园？许多历史的事实都表明，在一个民族遭到侵略的时候，为了保卫自己的家园，势必要同敌人进行拚死的战斗。然而在尼雅遗址中，有那么多的房舍，却都没有见到战火的痕迹，说明这里没有发生过大规模的战争。于阗统治尼雅，也是武力威胁的结果，但是，尼雅人却没有逃亡。为什么苏毗人的威胁，却可以使他们逃亡呢？这恐怕很难说出道理来。
再退一步说，如果说尼雅的地理环境没有发生恶化的话，即使是尼雅人离开了这里，也会有别的民族到这里居住。这样的例子很多，例如西辽河流域，原是鲜卑人所居。鲜卑人走后，契丹人来居住；契丹人走后，女真人来居住；女真人走后，蒙古人来居住。这里始终没有中断过人类活动。然而尼雅人走后，这里却没有发现再有别的民族来居住。这就说明了一个很清楚的道理，尼雅河下游严重缺水、少水，人类已经再也无法在这里继续居住生活了。
如果说尼雅的废弃与人类有关的话，那么可以说是尼雅人的活动破坏了这里的地理环境，引起沙漠化的结果。尼雅河是在黄土层上流动，黄土层是不漏水的。在尼雅人的耕种破坏了黄土层以后，导致地下的粉沙层暴露出来。粉沙层的透水性很强，河水流到粉沙层上，就会漏入地下，变得无影无踪。在河水非常充足的条件下，河水挟带的泥土会沉积下来，形成黄土河床，这需要很长很长的时间。由于尼雅河水的流量不断减少，它已经失去了这种沉积作用。因此，我们可以说尼雅人的活动，对于尼雅河的退缩产生了一定的影响。
尼雅文明衰落了，尼雅人离开了尼雅，但是尼雅人不会消失，而是迁移到其它地方居住生活。至于尼雅人是什么时候离开尼雅的？尼雅人离开尼雅以后，迁移到什么地方去了？现在的尼雅人是什么人？尼雅人与现在的维吾尔人有无关系？这些重要的问题，由于资料的不足和研究水平所限，目前还很难作出确切地回答。