本草纲领论
天地所生万物，皆感五运六气之化，故不出五气、五味、五色、五行、寒热温凉、升降浮沉之别。
经云∶五味阴阳之用，辛甘发散为阳，酸苦涌泄为阴，淡味渗泄为阳，咸味涌泄为阴，六者或收、或散、或缓、或急、或燥、或润、或软、或坚，随所利而行之。此物性之纲领也。五气、五味，各归所喜。
酸先入肝，苦先入心，甘先入脾，辛先入肺，咸先入肾。肝色青，宜食甘；心色赤，宜食酸；肺色白，宜食苦；脾色黄，宜食咸；肾色黑，宜食辛。辛散，酸收，甘缓，苦坚，咸软。毒药攻邪，五谷为养，五果为助，五畜为益，五菜为充，气味合而服之，以补益精气。四时五脏之病，随五味所宜也。又肝苦急，急食甘以缓之，欲散，急食辛以散之，用辛补之，酸泻之，心苦缓，急食酸以收之，欲软，急食咸以软之，用咸补之，甘泻之，脾苦湿，急食苦以燥之，欲缓，急食甘以缓之，用苦泻之，甘补之；肺苦气上逆，急食苦以泄之，欲收，急食酸以收之，用酸补之，辛泻之；肾苦燥，急食辛以润之，（辛又能润，为能开发腠理，致津液通气也。）欲坚，急食苦以坚之，用苦补之，咸泻之。又辛走气，气病无多食辛；咸走血，血病无多食咸；苦走骨，骨病无多食苦；（《灵枢》苦走血，咸走骨。）甘走肉，肉病无多食甘；酸走筋，筋病无多食酸。此五味补泻宜忌之纲领也。夫百病之生也，不出乎表里、阴阳、寒热、虚实。虚者补之，实者泻之，寒者热之，热者寒之，坚者削之，客者除之，劳者温之，（凡甘温、辛温，皆从补。）结者散之，留者攻之，燥者濡之，急者缓之，散者收之，损者温之，逸者行之，盛者折之，惊者平之，高者抑之，下者举之，微者逆之，甚者从之，上之下之，摩之浴之，薄之劫之，开之发之，适事为故，逆者正治，从者反治。此治病之纲领也。万物各有自然之性，凡病自有当然之理，即物以穷其性，即病以求其理，得其性理，豁然贯通，则天地所生之万物，人生所患之百病，皆归一致矣。用之可十可百，推之可万可千，岂不绰然有余裕哉！
药性形名论
按《本草纲目》金石、草木、禽兽、果谷，自神农及今，计一千六百余种，命名之义，各有思存。如黄连、白芷、青黛、元参之类，以色而命名也；甘草、苦参、酸枣、细辛之类，以味而命名也；寒水石、腽肭脐、火硝、香薷之类，以气而命名；桑皮、橘核、杏仁、苏子之类，以体而命名也；夏枯草、款冬花、长春、秋葵之类，因时而命名也；防风、续断、决明、益智之类，以功能而命名也；钩藤、兜铃、狗脊、乌头之类，以形象而命名也。命名之义，不能枚举，施于治道，各有功用。如五气分走五脏，五味逆治五行，皮以治皮，节以治骨，核以治丸，（松节、杉节及草根之多坚节者，皆能治骨。荔核、橘核之类，治睾丸。）子能明目，藤蔓者治筋脉，肉者补血肉，各从其类也。如水草、石草，其性主升；梢杪子实，其性主降；甘香之品，能横达于四旁；寒热之气，性浮沉于上下，在土之根 ，本乎上者亲上，本乎下者亲下；在外之枝干，在根者治本，在枝者行于四肢。此物性之自然也。又如夏枯之草，夏收之术，半夏之生， 麦之成，皆得火土之气，而能化土，秋英之菊，秋鸣之蝉，感金气而能制风；凌冬不凋者，得寒水之气，而能清热；先春而发者，秉甲木之性，而能生升。此感天地四时之气，而各有制化也。甘温者补，苦寒者泻；色赤者走血，色白者走气∶赤圆者象心，白瓣者象肺，紫尺者益脾，香圆者入胃，径直青赤者走肝，双仁圆小者补肾，以形色之相类也。（以象形而治五脏，详《金匮要略》。）阳者主上，阴者主下，阴中之阳升，阳中之阴降；轻清者主上，重浊者主下，浊中之清升，清中之浊降。凡物感阴阳之气而生，各有清浊升降之质性者也。又如山桅炒黑而降，黑豆黄卷而升，红曲生血，神曲化 。此假造酿而得化功者也。因名而取实，因象以用形，得其性之升降浮沉，气之温凉寒热，色之青黄赤白，味之甘苦酸辛，一千六百余种，大概不越乎此矣。
草木不凋论
草木寒不黄陨，及花发于冬者，得冬令寒水之资也。木生于水，水通于天，水火相济，水由地行，水气之通于四脏者也。如麦门冬、款冬花、枇杷叶、侧柏叶、山豆根、巴戟天之类，肾之肺药也；黄连、菖蒲、山桅、南烛、茶花、梅花之类，肾之心药也，浓朴、豆蔻、丁香、枳橘之类，肾之脾药也，菌桂、竹、密蒙花、女贞实之类，肾之肝药也。夫肾为水脏，受藏五脏之精，而复还出于四脏，入肝为泪，入心为血，入脾为涎，入肺为涕，上下交通，而外注于九窍。是以得寒水之草木，能启阴气上滋四脏，复能导四脏之气而下交于阴，又匪独肾气之通于四脏。五脏之气，皆相贯通，而药性亦然。如枣仁脾之心药也，石斛脾之肾药也，芍药脾之肝药也，桑皮脾之肺药也。类而推之，总不出五行之生化。
四气逆从论
经云∶升降浮沉则顺之，寒热温凉则逆之。谓春宜用升，以助生气；夏宜用浮，以助长气，秋时宜降，以顺收令；冬时宜沉，以顺封藏。此药性之宜顺四时者也。春气温，宜用凉；夏气热，宜用寒；秋气凉，宜用温；冬气寒，宜用热。此用气之宜逆四时者也，而病亦如之。然时气、病气，又皆有常有变，知其常变，反其逆从，可以把握阴阳，裁成造化矣。
大枣
枣色黄、味甘，脾家果也。夫木末之实，而为心家果者，生化之道也；木末之实，而为脾家果者，制化之道也。盖天地所生之万物，咸感五运六气之生化，明乎阴阳、生克之理，则凡物之性，可用之而生化于五脏六腑矣。元如曰∶桃为肺之果，核主利肝血；杏为心之果，核主利肺气。亦制化之理然与！
栀子
栀子冬不陨叶，五月感一阴之气，生花六出，洁白芬香，得金水之气也。其实结于枝梢，圆小赤色，味苦性寒，乃阴中之阳，肾之心品也，故炒黑而成离中之虚，导心火以下交于肾。元如曰∶六者，阴之终也，花多五瓣，如雪花、栀子花、玄精石，皆感阴气生成。
枇杷
枇杷四季长青，叶上多毛。凡草木之生毛者，皆主治肺；多刺者，花开于秋者，皆得坚金之气，而能制风。枇杷初秋结蕊，深秋放花，夏时果熟，又得冬令之气，能引寒水以上滋，利肺气以下降，故主治咳嗽卒 ，并下气消痰。
款冬花
款冬花气味辛温，生于关中，及雍州山谷溪水间，冬时发条，结蕊于冰雪中，故名款冬。（西北气寒，冰雪至夏不消，款冬辛温，可为大热者矣。）土人谓之看灯花，又曰敲冰取款冬，谓在正月前半月采之，如过元宵灯节，花即大放矣，此阴中之阳升也。如形寒饮冷，肺气虚寒作喘者宜之，若阴火上炎，肺叶焦满，恐益消烁毁伤矣。
泽泻
泽泻，水草也。凡水草，石草，皆属肾，其性主升。盖天气下降，地水之气上升，自然之理也。凡物之本乎上者性升，本乎下者性降。泽泻形圆，无下行之性矣。春时丛生苗于水中，独茎直上，秋时白花作丛，肾之肺品也。《易》曰∶山泽通气，能行在下之水。随泽气而上升，复使在上之水，随气通调而下泻，故名曰泽泻。元如曰∶如何首乌形圆茎蔓，其性惟升；牛膝形细而长，其性惟下，故主治在下。诸品可类推之。
芍药
芍药气味苦平，苦走血，故为血分之药；苦下泄，故本经主邪气腹痛，除血痹，破坚积寒热。因其破泄，故《太阴篇》云∶太阴为病，脉弱，其人续自便利，设当行大黄、芍药者，宜减之，以其人胃气弱，易动故也。今人咸云∶芍药主酸敛，而不知有大黄之功能。元如曰∶芍药乃神农中品之药。本经曰气味苦平，后人增曰酸，而实未尝酸也。（卢子由曰∶市肆一种赤芍药，不知为何物草根，儿医、疡医多用之，此习已而不察，其为害殊甚。）
牡丹皮
牡丹皮色赤，气味辛寒，血分之药也。不缘子生，故名曰牡。阴中之阳，升也。其味辛，故主发散中风，寒热邪气，除症坚瘀血，寒能凉血，故主螈 惊痫。凡骨蒸劳热，痈肿疮疡，丹皮为要药，若吐血衄血，大非所宜，以其上升故也。元如曰∶若因风寒而衄血者宜之，如阴火上炎者大忌。
栝楼
凡草木之根，其性上升，梢杪子实，性复下降，物之理也。栝楼蔓延结实，则根粉尽消，实黄赤而子白润，气味苦寒，是以天花粉能启阴液以上滋于心肺，栝楼实复能导心肺之气以下行，故本经主治胸痹。元如曰∶如苏子、萝葡子、白芥、云苔之类，性皆下行，所谓“上行极而下”也。
麦芽
麦，春长、夏成，得木火之气，故为肝之谷；透发其芽，能达木气，以制化脾土，故能消米谷之实。
经云∶食气入胃，散精于肝，淫气于筋。人之食饮不化，而成反胃噎膈者，多因肝气郁怒所致。予治此证，于调理脾胃药中倍加麦芽，多有应手。盖医者但知消谷，而不知疏肝。玉师曰∶可类推于谷芽、黍芽、大豆黄卷。
薯蓣
薯蓣，古名也，避唐宋帝讳，改名山药。种植之法，切作薄片，随所杵之窍而长之。（卢子由先生治一血利，久久不愈，曰∶此肠内有血管矣。山药随所杵之窍而长满，性能塞管，用山药为君，配血药而愈。此乃意度之妙用。）又百合之白花者，摘碎埋于土中，一瓣即生百瓣，而成一蒲。夫凡物切碎，皆成腐秽，二品所生之异，盖得本体之精，感气化而生长。山药肉内多涎，仲景用百合汤，以水浸一宿，出其白沫。涎沫，乃其精也。气生于精，二品得精气之盛，故主补中益气，长肉强阴。元如曰∶凡物多精汁者，皆主养精补血，益气生肌。
枸杞
《神农本经》，总名枸杞，无地骨皮、枸杞子之分。盖枸字谐狗，杞字谐己，狗属戌，而戌主右肾，肾主骨，而己属阴土，故有地骨之名，而久服能坚筋骨。气味苦寒，能清热中消渴，盖能助水土之气，上滋心肺者也。其子色赤性寒，能补两肾之精气，骨之精为瞳子，故助瞳子之光明。
红花
红花色赤多汁，生血行血之品也。陶隐居主治胎产血晕，恶血不尽绞痛，胎死腹中。金匮方红兰花酒，治妇人六十二种风，又能主治 疟。临川先生曰∶治风先治血，血行风自灭。盖风乃阳邪，血为阴液，此对待之法也。花 茎叶，且多毛刺，具坚金之象，故能胜制风木。夫男女血气相同，仲祖单治妇人六十二种风者，良有以也。盖妇人有余于气，不足于血，所不足者，乃冲任之血，散于皮肤肌腠之间，充肤热肉，生毫毛，男子上唇口而生髭须，女子月事以时下，故多不足也。花性上行，花开散蔓，主生皮肤间散血，能资妇人之不足，故主治妇人之风。盖血虚则皮毛之腠理不密，而易于受风也。此血主妊娠，故专治胎产恶血。《灵枢经》云∶饮酒者，卫气先行皮肤，故用酒煎以助药性。疟邪亦伏于募原之腠理间，故能引其外出。夫血有行于经脉中者，有散于皮肤外者，而所主之药亦有不同。如当归、地黄、茜草之类，生养脉内之血者也，红兰花主生脉外之血者也；川芎、芍药、丹皮、红曲之类，又外内之兼剂也。学人能体认先圣用药之深心，思过半矣。
石膏
石膏气味辛甘微寒，《神农本经》主中风寒热，心下逆气，惊喘，口干舌焦，不能息，腹中坚痛，除邪鬼，产乳，金疮。仲景用麻黄配石膏，能发阳明水液之汁，白虎汤解阳明燥热之渴，又主风热发斑。是神农、仲景皆用为发散之品。盖气味辛甘，而体质疏松如肌理，但其性沉重，色白若金，故直从阳明而达于外也。后人咸谓清内热而主降下，乃不明经义、物性故耳！夫凡物有可升可降者，配发散之药则升，配破泄之药则降。如浓朴之气味苦温，本经主中风、伤寒，头痛，寒热，乃发散之药也。仲景承气汤，配枳实、大黄、芒硝，为急下之剂。经云∶酸苦涌泄为阴。盖酸苦之味。
能上涌而下泄也。同升药则升，同降药则降，立方配合，乃医家第一义，讵可忽诸！
女贞实
女贞子，乃本经上品，气味苦平，主补中，安五脏，养精神，除百病，久服肥健，轻身不老，强阴，健腰膝，变白发，明目。即蜡树也。立夏前后，取蜡虫种子，裹置枝上，半月后，其虫化出，延缘枝上，造成白蜡，坚白如凝脂，犹蚕食桑而成丝，连绵温暖，皆得树质精华，是以桑根白皮，主伤中，五劳六极，羸瘦，崩中绝脉，补虚益气。女贞虽与冬青同名，其种实异。冬青名冻青，叶微圆，子赤色，虫不造蜡为别也。世俗混用冻青，实二物，功用迥别。采择者，不可不辨！
莲实
莲子，本经上品，气味甘平，主补中养神，益气力，除百疾，久服轻身耐老，不饥，延年。夫莲茎色青味涩，中通外直，具风木之象，花红，房白，须黄，子老而黑，有五行相生之义，故能补五脏不足。五脏主藏精者也，肾为水脏，受藏五脏之精。石莲子色黑味涩，故用之以固精气。今市肆一种，状如土石，味极苦涩，不知为何物？卢子由先生曰∶食之令人肠结。宜于建莲子中，拣带壳而色黑者为是。（有云假石莲子乃树上所生，即苦珠子之类。）
桑上寄生