日晷上发出的光芒足足持续了十几秒的时间才渐渐减弱，当小智一行人睁开眼睛的时候，只见周围到处都是之前在卡洛斯联盟密阿雷大会时遇到过的藤蔓状的巨大神秘植物，那些植物不断从地面中长出，不时就有人被这些从地上长出的藤蔓缠住、挤压。
训练家们指挥着宝可梦们破坏着这些藤蔓，同时君莎小姐也在指挥着人们迅速撤离。
日晷上方的天空中打开了一个黑色的空洞，隐隐能够察觉到其后还有一条不知通往何处的通道。
“弗拉达利，这就是你所谓的新世界吗？”小智大喝道。
“……”弗拉达利没有说什么，但脸上分明有着惊疑不定之色。
“不好了！”乔伊小姐从远处跑了过来，脸上带着慌忙的神色。
“怎么了，出什么事了吗？”卡露乃严肃地问道。
“整个卡洛斯地区都已经出现了这种藤蔓。”乔伊小姐说道，“再这样下去，卡洛斯地区会被彻底破坏的。”
“什么！”众人都是心惊。
“不能再这样下去了，必须尽快解决才行。”帕琦拉说道。
“想要结束这一切，恐怕还得从那里下手。”可可布尔指了指上空的黑色洞穴，说道。
“吾能够感觉到，那个黑色洞穴里散发出来的能量，远胜于吾。”基格尔德完全体说道。
“小智，该不会是……”瑟蕾娜说道。
“很可能是阿尔宙斯分出的那股邪恶力量干的。”小智说道。
“也只有那种力量，才能完全凌驾于基格尔德之上了。”史特隆说道。
“小智，你们说的是什么意思啊？”芙芦拉问道。
小智简单地将事情讲解了一遍，随后望向胡帕，说道：“胡帕，麻烦你将其他人也带过来吧。”
胡帕现在已经是精力充沛，闻言在圆环内一抓，将小刚和两只超梦给传送了过来。
胡帕又在圆环内探了探，将达拉和急冻鸟、小霞、奈奈、莉拉、急冻鸟、闪电鸟、洛奇亚、水君、小遥、卡侬、拉帝亚斯、固拉多、盖欧卡、裂空座、代欧奇希斯、玛娜菲、小光、琴音、水君、由克希、亚克诺姆、艾姆利多、席多蓝恩、谢米、克雷色利亚、达克莱伊、火焰鸟、达克莱伊、艾莉丝、丹特、白露、捷克罗姆、莱希拉姆、酋雷姆、比克提尼和美洛耶塔给传送了过来。
大片的传说的宝可梦聚集在一起，场景惊人。
小智一行人快速地将之前的事情说了一遍，一众传说的宝可梦皆是望着那黑色的洞穴，沉默不语。
神秘植物从地面中长出，不断缠绕向他们，传说的宝可梦们纷纷出手，将这些藤蔓消灭。
“不从根源解决的话，是没办法结束的。”可可布尔说道，“小智，这里就交给我们吧，就拜托你们前往洞穴的另一端了。”
“是！”小智一行人闻言，顿时分别上了传说的宝可梦们的背部，随后一众传说的宝可梦们纷纷飞入上方的黑色空洞，失去了踪影。
……
神奥地区，天冠山。
对战金字塔从天空远方飞来，随后缓缓降落。
对战金字塔上的门徐徐打开，神代带着雷吉洛克、雷吉艾斯、雷吉斯奇鲁和雷吉奇卡斯，走向了天冠山内部。
没过多久，他们就来到了枪柱附近。
神代取出金刚宝珠和白玉宝珠，放在了柱子上。
“拜托你们替代湖中的宝可梦，为那三根柱子提供能量。”神代说道。
雷吉洛克、雷吉艾斯和雷吉斯奇鲁分别走到三根柱子前方，手按了下去，顿时两个宝珠和三只宝可梦身上同时发出光束聚集在一起，随后又分散到两边，两个洞口从虚空中打开，帝牙卢卡和帕路奇亚从中逐渐出现。
没过多久，帝牙卢卡和帕路奇亚就从中彻底出现。
“帝牙卢卡、帕路奇亚，事情是这样的……”神代将事情交代了一遍，“我们需要你们的帮助，以对抗即将到来的黑暗危机。”
帝牙卢卡闻言点了点头，而帕路奇亚则是手一挥，身旁迅速出现了一道缝隙。
帕路奇亚身形连动，那缝隙越来越大，随后帕路奇亚向着神代挥了挥手，率先进入了那道缝隙中。
紧接着，帝牙卢卡也跟了进去。
“是叫我也进去吗……”神代思索着，带着雷吉奇卡斯、雷吉艾斯、雷吉斯奇鲁、雷吉洛克也跟着进去了。
……
卡洛斯地区上空。
坂木望着满是神秘植物的地面，冷笑了一声：“看来已经开始了。”
说着，坂木的手向前一指，顿时一只只神秘图腾围绕着前方转了起来，随后打开了一个洞口。
没有什么犹豫，坂木就钻了进去。
……
没过多久，火箭队三人组的飞机也来到了百刻市上空。
“喵喵，那些神秘植物不是之前出现在密阿雷大会上的吗？”小次郎问道。
“是啊喵，这些神秘植物不是已经被消灭了吗，怎么还会出现？”喵喵问道。
“你们快看那里。”武藏指了指日晷上方的空洞，“那个洞口好像在变大。”
“真的喵。”喵喵说道。
“我们再靠近点看看。”小次郎说着，开着飞机缓缓朝着那空洞飞去。
忽然，空洞中传出一阵吸力，将火箭队的飞机吸了进去。
……
卡洛斯地区边缘的上空，刚刚飞到了卡洛斯地区边缘的亚希达忽然停了下来，脸色一变：“怎么可能？连接那里的通道已经被打开了？”
顾不得再慢慢飞行，亚希达身旁突然浮现十七块石板，石板围绕着亚希达旋转起来，紧接着，十七块石板中分别发出光芒，在面前凝聚起来，打开了一个空间通道。
亚希达一挥手，带着基拉祈一同飞进了那通道。
……
小智一行人在通道中穿梭着，不知道过了多久，忽然众人感觉身体一沉，随后落了下去。
“这里是……”小刚四处张望着。
“好黑暗的地方。”小建说道。
“科学开拓未来的时刻，史特隆特制引擎，on！”史特隆说着，背后的机械臂就从背包中拿出了一个手电筒般的东西，“这是事先预料到这种情况而发明的伟大机器，光照探测仪！”
“科学的力量真伟大！”小智说道。
“这……只是普通的手电筒吧……”尤莉嘉说道。
史特隆打开了手电筒，向四周一照，一行人的脸色都不由得变得难看起来。