前期作为大蛇丸的部下在木叶活跃，擅长使用医疗忍术。幼年时因受伤而失忆，被孤儿院院长药师野乃宇收留，但后来因为团藏要挟野乃宇，于是自愿为野乃宇以及孤儿院去投靠团藏作为一个忍者活跃于木叶。
从小被当做间谍而游历各国，但团藏却安排兜与野乃宇自相残杀，自从误杀野乃宇后，兜就认为自己失去了生存意义。
与此同时，大蛇丸找到了兜，邀请兜加入音隐村，自此之后便当了大蛇丸的手下。大蛇丸被十拳剑封印后，兜为了寻找真实的自己而去模仿大蛇丸的生存道路，获得了大蛇丸及其部下音忍五人众的能力，而且自己在龙地洞修炼了仙人模式，并扬言利用他人来伪装自己，探索世界的真理。在与佐助和鼬的战斗中陷入幻术伊邪那美。最后重拾自我，并前往战场治疗佐助。战后被允许在木叶开设孤儿院，回到自己最向往的生活。
“兜”的名字，是他在孤儿院时院长药师野乃宇起的名字；“药师”的姓氏则是继承了野乃宇的姓氏。
“药师”一词源自传说中的神祇药师如来。传说中的药师如来能为信徒消除烦恼，免其受苦，消灾延寿，灭除一切灾劫病苦。另外，照字面意思，药师的名字正显示了其对药物（兵粮丸、凝血丸）及医术的精湛掌握，所以在漫画中发现药师兜使用过各种药丸，以及高级的医疗忍术。
仙人模式
在制造查克拉的基础上聚集自然能量，从而制造出仙术查克拉，威力是普通查克拉的两倍甚至数倍，而且能够利用自然能量感知周围的查克拉或生命体。使用仙人模式后身体会发生一定的变化，只有出现眼影的仙人模式最为完全。
掌仙术属于阳遁，在双手上集中绿色的查克拉，当触摸受伤者身体后不论内伤外伤都可靠放出的查克拉达到惊异的恢复速度，也可藉由放出的查克拉干扰他人身体内查克拉的循环，造成昏睡状态等。
查克拉手术刀属于阳遁，把查克拉集中在手部，可以切割身体任何一处做进一步医疗，也能移植任何器官，还可以用在战斗中打断对手的肌肉与经络，甚至可以作为武器切割对手。
阴愈伤灭属于阳遁，与掌仙术等同属医疗忍术。使用者要在受到对手攻击前，正确判断会被击中的位置，并迅速在该位置集中一定分量的查克拉；被击中后，伤口会自动回复。
死魂之术将已死之人的心脏临时跳动起来，而自己则变成目标的尸体倒在地上并寻找机会逃离。兜在和大蛇丸见面后，暗杀了四名暗部并潜入佐助的病房，后来遇上前来保护佐助的旗木卡卡西，便利用这招把拥有写轮眼的卡卡西给骗了。
大蛇丸流替身术兜融合了大蛇丸的身体细胞后所获得的忍术。利用外部的身体作为替身，从口中钻出本体，属于完美的替身术。弱点是会消耗大量查克拉，且短时间内身体虚弱。
潜影蛇手兜融合了大蛇丸的身体细胞后所获得的忍术。原为大蛇丸所开发的忍法，从袖中快速窜出一条蟒蛇，以便牢牢绑住对方。
潜影多蛇手兜融合了大蛇丸的身体细胞后所获得的忍术。潜影蛇手的加强版，蛇的数量变得更多，能够短时间内缠住对手。
水化之术兜利用大蛇丸实验室所留下来的资料和研究报告，得到的鬼灯一族的能力。可以将肉体液化从而抵消一些攻击。（这个术的名称暂且不明，只是能力相仿水月的术，但应该不是同一种术，仅供参考）
体能治愈兜调查属于漩涡一族的香燐的身体后得到的忍术。一旦受到伤害就会自动恢复。
水遁
大瀑布之术使用查克拉使用犹如大瀑布的巨大水量猛烈冲击敌人，杀伤力非常大。
水龙弹之术聚集大量的查克拉后制造出一条巨型水龙进行攻击，施术速度快，冲击力猛。兜在与佐鼬兄弟对战时准备使出此术，却被鼬用写轮眼月读来反击，兜陷入伊邪那美轮回的时候，此术被鼬复制使用。
通灵术
秽土转生之术此术由二代目火影开发，该术可将早已过世的忍者灵魂召唤回人世，并以实体的形式复生，被复活的人可以被施术者的操控，但施术者可以解除控制，此外如果被施术者知道秽土转生的印可以主动解除秽土转生契约。
蛇兜融合了大蛇丸的身体细胞后所获得的忍术。与蛇签订血之契约，可以随时通灵出不同数量及种类的蛇。
二代万蛇利用万蛇的细胞所制成的新万蛇，与万蛇的区别是长出了前肢，实力比万蛇强。能轻松缠住雷之国海岸上的巨型岛龟的脖子。
幻术涅盘精舍之术只要看到降落的白色羽毛，会进入安详而深沉的睡眠，与一般幻术不同的是范围非常广泛。兜曾用此招令中忍考试的所有观众进入睡眠。（除了卡卡西、凯、小樱、鹿丸以及一些音忍）
仙术
仙法
白激之术
药师兜进入仙人模式使用的仙术之一，此术的效果可以让周围一定区域内的空气会不断的振动，从而让受攻击者感觉全身的骨头都在摩擦，甚至导致受攻击者身体麻木，并且施展此术所发出的强光和声音会损害受攻击者的视觉和听觉。此术之可怕，导致对手都无法维持须佐能乎的状态。可以让身体液化，轻易缓冲震动，还可以通过蛇的眼角膜遮挡强光，还可防必须通过目光对视才能发动的写轮眼幻术，所以在这个术的效果下，白蛇仙人可以自由行动。
无机转生
药师兜进入仙人模式使用的仙术之一，这是一种可以赋予没有生命的无机物以生命并加以控制的转生忍术。并非是简单的利用查克拉控制物质的忍术，并且该术的作用下无机物行动迅速。
传异远影先利用左近的双魔之术使身体分裂出一个个体，然后可以使用兜移植过细胞的忍者们的术。
移植忍术双魔之术兜移植了音忍五人众之一的左近的细胞后所得到的忍术。在自己的身体腹部上生出一个独立行动的个体，不过与左近和右近这两个拥有独立意识的个体不同，此个体依然受到了兜的控制，只不过是兜施展忍术的媒介。该个体可以变成左近、次郎坊、多由也、鬼童丸、君麻吕和大蛇丸的形象。
土遁土陆翻转兜移植了音忍五人众之一的次郎坊的细胞后所得到的忍术。可以把前方的土地提起来并分成两半，以便制造出一条裂缝坑。兜使用的目的是在被天照大火覆盖的区域开一条路。此招大和也曾使用过。
蜘蛛巢开兜移植了音忍五人众之一的鬼童丸的细胞后所得到的忍术。制造一张或多张巨大的蜘蛛网困住对手，一般的刀无法切断。
魔笛音锁兜移植了音忍五人众之一的多由也的细胞后所得到的忍术。兜用君麻吕的骨头做了根笛子，用笛音迷惑在进入虚拟幻镜，身体被束缚着的慢慢开始融化，曾以此同时令鼬和佐助陷入幻术当中。
早蕨之舞兜移植了音忍五人众之一的君麻吕的细胞后所得到的忍术。连续性地从地上快速长出尖锐化的骨头袭击对手，生长停止后总共的数量极多，后被宇智波鼬用须佐能乎解决掉。
白鳞大蛇兜移植了大蛇丸的细胞后所得到的忍术。化身成白鳞大蛇，每块蛇鳞也可化成蛇。能够吸收对手及其能力。
药师野乃宇养母曾是根的成员之一，之后担任了一所孤儿院的院长。对于兜来说，野乃宇对他一生的影响都是至关重要的，就像是自己的妈妈一样。
乌鲁西“哥哥”与兜被同一所孤儿院中收留，外传中则与兜一同在木叶忍村开设孤儿院。
大蛇丸上司火之国木叶村的叛忍，木叶村的“三忍”之一，与自来也、纲手同为第三代火影猿飞日斩的弟子。
蝎被誉为天才傀儡造型师，人称“赤砂之蝎”。曾经作为大蛇丸的探子做过蝎手下的间谍。
赤胴铠
队友
虽然表面上是木叶的往届学生，但是他的真正身份是音村的间谍。
剑美澄音忍村的忍者，带着一副圆边眼镜和长条口罩把容貌遮住。
宇智波信的剩余克隆人们养子外表上是少年男性。白色短发，皮肤苍白，衣服背面是宇智波一族家徽。仅双眼为写轮眼。
第三次忍界大战时期，兜在不知父母及名字的状况下被孤儿院院长药师野乃宇收留，幼年时期就天资聪颖，但由于视力不佳，因此院长将自己的眼镜送给兜，同时学会了医疗忍术，但在一次帮助木叶忍者疗伤时初次遇见了还是木叶忍者的大蛇丸，因此被大蛇丸发现他的天赋。后来志村团藏连同大蛇丸和一名油女一族成员突然出现在孤儿院，威胁曾在谍报部有“行走的巫女”之称、旧名药师野乃宇的院长前去长期侦察岩忍者村是否有拟定大规模作战计划，团藏在察觉到在窗外偷听的兜后，声称需要孩童成为木叶忍者来替补获得这次情报牺牲的团藏部下，并以补助金作为交换条件，成功将兜纳入自己麾下。
从此，兜被培训成忍者间谍，在云、雾、砂、岩等其余国家的忍者村搜集情报，擅长伪装自己的行踪及气息。
五年后在岩忍者村待命的兜因为失误遭遇袭击，与他交战重伤的敌方忍者竟然就是院长，试着呼叫她，但濒临死亡的院长不认得他，随后兜被其他支援的敌方忍者逼退，迷惘的兜独自一人到了河边思考着自己为何会被最重要的人给遗忘，这时遇见大蛇丸，被带至他的基地作为第一位访客，随后从大蛇丸口中得知团藏在他一离开孤儿院就向院长说出其实兜是为了他们的补助金而自我牺牲、加入了“根”，在院长的请求下团藏宣称只要杀死某个人就会解放兜，而那个要杀死的人实际上就是“真正的兜”，原来一开始团藏为了避免两人相遇把他们分配到不同地方执行任务，院长只能借由照片了解兜的成长过程和安全与否，而照片在中途被换成别人的照片，导致不知情的院长去杀害被她当成双重间谍又试图解救的兜本人，而大蛇丸原本是奉命要同时解决掉兜和院长，但是因为看上兜的才能而不想执行，在得知真相的兜决定接受大蛇丸邀请加入不隶属任何国家的音忍者村，并利用大蛇丸为他捏造的身份重返木叶。
大蛇丸加入晓以后，让兜假装跟随蝎。蝎以为兜被自己施了术以后，成了自己派去打入大蛇丸身边的间谍，但蝎没有想到的是，大蛇丸破解了他在兜身上施展的术，并反过来利用这一点刺探晓的情报。
初次在中忍选拔试会场内登场。当时他以木叶忍者村下忍的身份，前来参加考试，而且似乎是连续七次、共花了四年也没考上中忍（至少两次中途放弃），其实是为了收集情报。他的队友是赤铜铠及剑美澄（实际上三人均是音忍者村的卧底）。一出场他便遇上了鸣人等九位新人，并以热情的态度，利用忍者卡为他们详细解释前来参加考试的考生类型、能力、原属隐村及人数等。但当他谈及音隐村时，似乎说了些轻视音隐村的话，随即遭到音忍托斯的攻击。他自以为已避开托斯的攻击，但孰料托斯使用的是音波攻击，使他耳水不平衡、呕吐及眼镜碎裂（事后对大蛇丸透露自己先前不知道会有这些代表音隐村的忍者参赛，因此才会刻意隐藏实力试探他们）。后来第一场考试的考官森乃伊比基的出现，中止了音忍、药师兜及鸣人他们之间的胡闹。
到了第二场中忍考试──“死亡森林”临近结束时，他遇上了有“地之卷轴”、但没有“天之卷轴”（通过考试所需之两卷轴）的鸣人他们。佐助得知兜已取得了“天之卷轴”及“地之卷轴”，就提出跟兜交战的要求。
但兜认为他们如若想取得“天之卷轴”，就更应该到终点塔之附近埋伏，因为那里有比较多的考生正赶赴终点。不过，兜亦指出那里也有其他跟他们相同想法、并在那里埋伏的考生，所以为了自身安全要和他们一同前往终点之塔。
就在差不多到了塔附近之时，遇上了来自雨隐村的下忍篝、梦多及胧。
因这三名雨忍不擅长近身攻击，所以他们使用了自己擅长的幻术及分身术，并把自己的真身隐藏起来。他们的目的就是想利用分身消耗鸣人、兜他们的体力，等鸣人他们的查克拉用尽后，便现身解决他们。兜在与分身的战斗中，为了保护鸣人他们而被偷袭受伤。后雨忍三人的真身被发现，并被漩涡鸣人击败，成功取得“天之卷轴”。兜及鸣人四人顺利到下一场考试的试场。
但就在中忍预赛考试前夕，他与队友私下跟前来夺取佐助的大蛇丸会面，汇报了佐助的情况及表现。之后以受伤为由先行退出第三场考试的预赛，让鸣人为他感到遗憾。然而事实上当时只有我爱罗能够打败拥有上忍实力的兜。
中忍选拔试退出后，就一直活跃于大蛇丸身边，并跟砂之上忍叶鬼保持联络，开始音忍、砂忍联手攻打木叶隐村的准备。大蛇丸曾警告他不要做出违背目的的事，否则会杀死他（但后来戏说只是笑话），但他看着大蛇丸的未来容器──拥有写轮眼的宇智波佐助就想到了自己，“太过优秀其实是很悲哀的”，因为这个想法，他趁佐助在医院休息（因中了大蛇丸天之咒印而不适）时，打败旗木卡卡西派来看守病房的四名暗部忍者，打算刺杀佐助，之后他似乎想用刀刺在佐助身上，但其实他是把刀抛向早已来到病房的旗木卡卡西。没想到站在那里的“兜”其实是他以死魂之术令其中一位已故暗部忍者暂时复活并变成自己制造假像，而自己则变身成暗部倒在地上，到适当时机便跳窗而逃，卡卡西亦表示面对兜未必能击倒他。
在第三场正式考试开始时，化装成暗部并出现于会场。他医治了当时身有内伤的日向雏田，但被犬冢牙的忍犬赤丸识破了身份，因此立即把牙及赤丸击晕。及后当大蛇丸开始行动时，他便以幻术·涅盘精舍之术使会场所有人陷入深沉的睡眠，然后跟观众席内隐藏的音忍及砂忍一起行动。他的身份亦很快被卡卡西揭穿，当大蛇丸的行动失败、双手被三代目火影废去后，兜跟砂隐村的叶鬼一同离去。
木叶隐村之战后，砂隐村亦向木叶隐村投降。此时大蛇丸的双手被三代的尸鬼封尽废去，不但要面对难以忍受的痛楚，而且也使不出忍术。作为大蛇丸身边的心腹及医疗忍者，他特制各种药物，但只能稍减大蛇丸的痛楚。最后决定一起前往寻找“传说三忍”之一、拥有高超医疗忍术的纲手，让她治疗大蛇丸的双手。后来他们在短册街的城堡处找到了纲手。大蛇丸向纲手提出条件，只要她肯答应医治，就可以把她重要的人──断及绳树进行复活，以及不会摧毁木叶隐村为条件。纲手尽管很想见到亲人，但她知道大蛇丸是不会轻易放过摧毁木叶隐村的机会，便假装肯医治大蛇丸，然后对他施以偷袭。兜看出纲手的偷袭，立即掷出手里剑分开大蛇丸及纲手。纲手跟大蛇丸、药师兜之战瞬间展开。
兜认为在城堡的地方不利于跟具有怪力的纲手对战，于是便把纲手诱至山丘处。跟纲手一路打到山丘后，他服下兵粮丸，并使出具攻击力的医疗忍术，把查克拉注入纲手手及腹的肌肉中，并加以损伤。对于兜的高超医疗忍术及身手，纲手也感到吃力。后来更对纲手胸口打了一掌，使其难于呼吸。纲手亦使出绝招──乱身冲，将查克拉化成电力注入兜体内，麻痹其神经系统，令兜不能自由活动。但凭兜的医疗知识，也很快就突破麻痹状态，正想进行反击；刚好也被赶到的自来也、静音及鸣人击退。
同时面对两名传说三忍－自来也及纲手，兜决定先麻痹纲手的攻击，向她展示她最害怕的血液；顿时纲手全身颤抖、动也不能动，只能任人攻击。兜也向鸣人揭露自己的真实身份，嘲笑鸣人只是个无能的小鬼，没有当忍者的才能。被兜挑衅的鸣人，自然不会放过兜。鸣人以多重影分身术攻击兜，但就如自来也所说，鸣人的实力和兜相差太远，完全不到作用。因此，自来也决定自己来对付大蛇丸，让静音与兜对战；另一方面，兜也协助大蛇丸召唤巨蛇。巨蛇袭向自来也他们，而兜袭击带着纲手逃离的静音。兜躲过静音的毒雾，然后从地中抓着并打断静音的脚筋，把她重摔在地上，并狂踢正于一旁颤抖的纲手。鸣人前来阻止，以护额挡住兜对纲手的攻击；但因大腿骨受伤、小腿伸直肌又被兜打断，无法跟兜对战，被兜轻松压制，劝鸣人快放弃成为火影的梦想、舍弃同伴及逃走。
尽管如此，以鸣人的强硬性格，依旧站在纲手面前保护她。鸣人约定要赢得纲手身上的项链、成为火影，奇迹般地接下了兜的致命攻击，并以刚学会的螺旋丸一击重创兜，伤及其内脏，连兜的医疗忍术也无法自愈。但兜在与鸣人接触的一瞬间，已用查克拉手术刀把鸣人的心肌切断，使鸣人在攻击后亦体力不支倒地。兜以为鸣人死定了，纲手为鸣人流的眼泪，使她的精神亦被唤醒了、对血已不再害怕，并为鸣人赌上性命，利用创造再生自愈、又召唤出通灵兽蛞蝓。自来也赶紧召唤出蛞蟆文太。兜见状立即协助大蛇丸召唤通灵兽──万蛇。经过一场混战后，大蛇丸及万蛇均被纲手、自来也联手击败。兜立即救醒大蛇丸，并与大蛇丸一同撤退。
自三忍一战结束后，兜正式退居幕后，在大蛇丸身边服侍及为其医疗。因为大蛇丸双手的痛楚日增，所以在宇智波佐助还未来到音隐村前，决定为大蛇丸挑选容器。他从牢中释放了许多被囚禁的忍者，以放胜利者离开为理由，让他们自相残杀，最后只剩下一名忍者──幻幽丸。幻幽丸答应奉献自己给大蛇丸作容器，以换取释放其他被囚禁的伙伴，终亦成为大蛇丸的新容器。
除此之外，兜亦为音忍五人众之一、拥有血继限界──尸骨脉的君麻吕治疗。君麻吕本是大蛇丸容器的选择之一，但因身体本有疾病，在暗杀风影后，已被大蛇丸抛弃。他就是一直在兜的治疗下生存着，直到他愿意协助把佐助带来音隐村、离开兜的治疗为止。兜此后在第一部已较少出现。
正如赤砂之蝎临死前对小樱所说，他在大蛇丸身边安置了一名卧底。兜就是他口中的那名卧底。大和、鸣人他们不知此事，于是便据蝎的资料，由大和变身成“蝎”，前往天地桥跟卧底会面。当他们知道兜原来亦是蝎派去的卧底，深感惊讶。兜跟化成“蝎”的大和展开谈话，说要按照之前任务所命、把大蛇丸转生后剩余的躯壳细胞样本交给“蝎”，并认为不能在此久留。然而，大蛇丸却突然在兜身边出现；兜瞬身走到“蝎”的身边，似乎是要与“蝎”一起对付大蛇丸。
结果没料到兜突然向“蝎”发动袭击。大和伪装成“蝎”的身份被识破，兜跟大蛇丸联手对付他，以及隐藏着的鸣人、佐井及樱三人。兜向他们透露自己确实是“晓”派来的卧底，中了蝎之术并受操控；但后来得到大蛇丸的协助而解除忍术，故已叛变并成为大蛇丸的部下。
面对大蛇丸，鸣人无比的愤怒使他现出了其中三尾，兜见状欲对鸣人施以偷袭，然而单凭鸣人强大的查克拉，已把兜打飞。不过兜的伤并不重，只消一刻时间便自我治愈了，亦了解到真正的蝎是不会再来，因为已经被眼前的这些人干掉了。他在一旁目睹进化成四尾的鸣人，跟拥有不死身的大蛇丸对战，并称这是“怪物之间的战斗”。经过一番激战，大蛇丸体力不支而退；而兜在救治被四尾鸣人所伤的小樱后（声称是留下他们的性命，让他们干掉更多“晓”的成员），便前往照顾大蛇丸。
三年期限已到，大蛇丸的容器面临极限，兜加紧为大蛇丸配制各种药物。却不知佐助就在大蛇丸处于虚弱时，破了其不尸转生之术，杀死大蛇丸并夺去其一切力量。当佐助从大蛇丸房间走出来的一刻，兜明白到经过他面前的已经不是大蛇丸，而是实力比大蛇丸更强的佐助。对从小当过不同国家的间谍、无家可归的兜来说，感觉再次失去人生目标及身份。然而他想起了鸣人既然能借由超越自身的力量、找到自己的真正身份，自己同样也可以做到。于是他便把大蛇丸的白鳞大蛇躯壳移植到自己的左半身，意图得到大蛇丸的力量，甚至超越他。但他却不擅于操控从大蛇丸移植过来的白鳞大蛇躯壳，因此却反给大蛇丸慢慢侵蚀。此外他也私下跟正追踪佐助的鸣人、雏田和大和会面，把详细介绍“晓”成员的资料本送给鸣人，以作为鸣人令自己有所“领悟”、及重新寻找身份的“礼物”。鸣人他们欲逮捕兜回木叶，但兜却以替身术避开，并且表示只要他能熟练运用大蛇丸的力量，便会和鸣人一战。但他表示要先对付佐助，鸣人想问兜要对佐助做什么，但他却消失在众人面前。
之后的修炼中，兜完全掌控了与大蛇丸相同的力量，身躯已经和蛇的形态融为一体，以至于外貌与大蛇丸极为相像。他在泷隐村杀人取尸体后和带土对峙时，自称已经超越第二代火影和大蛇丸，将宇智波鼬、蝎、迪达拉、角都和长门以秽土转生形式复活，并且以提供带土目前缺乏的战力来换取佐助交涉条件，对带土提议携手合作。带土本来因他以佐助为目标而想拒绝他。但兜在黑绝的帮助下找到了宇智波斑的尸体并秽土转生，最后带土被迫同意。交换条件是战争结果出炉前不能与佐助碰面，以及必须接受带土的监视。由于兜对转生者的束缚力不够，于是绑架前来侦查的御手洗红豆，并吸收她身上咒印的大蛇丸查克拉以强化控制力。
其后，药师兜使用龙地洞仙人模式与宇智波佐助以及使用别天神摆脱秽土转生的宇智波鼬交战，兜被伊邪那美击败后，被宇智波鼬用幻术控制解除秽土转生，除了宇智波斑之外，所有被秽土转生的灵魂都已解除秽土转生，但是宇智波斑知道如何脱离秽土转生的控制，在秽土转生即将解除之际，终止了与转生者之间的通灵契约，才得以继续留在战场，随后以解邪法印重生的大蛇丸取回自己的查克拉后与鹰小队同行。
兜最终重拾自我，终于脱离伊邪那美，以龙地洞仙人模式的状态出现在战场，在第二代火影的灵魂禁锢术的帮助下，兜使用医疗忍术抢救佐助，让佐助能够再战宇智波斑。
斑开启无限月读以后，兜连同其他人一起中了此术并被神树缠绕。
最终第七班结束了第四次忍界大战，无限月读被解除，包括兜在内的所有人终于重获自由。
由于兜已醒悟，并且曾在第四次忍界大战中抢救佐助，间接带来忍界大战的胜利，所以不用再被列入叛忍名单中。
兜与儿时的伙伴乌鲁西一同在木叶开设了孤儿院，并担任院长，重兴当年养母的旧业。
鸣人等人返回木叶后，将带回的一众克隆人“宇智波信”托付给了兜。