肾脏增大，表面苍白，被膜光滑，横切面可见组织肿胀和充填其中的黄色脂质，故亦称类脂质性肾病。

肾小球正常或轻度异常，无足细胞病理改变。肾小管上皮细胞可见空泡变性和透明滴。少数可见间质水肿，萎缩和灶性纤维化。亦可见间质炎症细胞浸润。

无免疫球蛋白和补体的沉积。少数可有部分IgG，IgM，补体（C3）的沉积，仅限于肾小球系膜区。

是微小病变性肾病唯一的特征性病理改变，可见广泛的足突融合。

FSGS表现为肾小球硬化性病变仅累及部分（局灶）肾小球，或受累的肾小球只有部分毛细血管袢（节段）发生病变。硬化是指肾小球毛细血管袢闭塞和细胞外基质增多。不同程度地伴有球囊粘连，足细胞增生、肥大、空泡变性，玻璃样变，节段性内皮细胞及系膜细胞增生，肾小管上皮细胞损伤，灶状肾小管萎缩，肾间质纤维化，泡沫细胞形成，以及肾间质淋巴、单核细胞浸润。

节段性IgM和（或）补体C3呈颗粒状，团块状在毛细血管袢（硬化部位）和系膜区沉积，可伴有相对较弱的IgG、IgA沉积；也可全部阴性。

足突融合是FSGS最常见的超微结构特点。FSGS节段硬化区毛细血管袢闭锁、塌陷，可见泡沫性巨噬细胞、细胞碎屑、脂滴、颗粒样基质等。病变后期，硬化处无细胞结构，与包曼囊壁粘连，进展为非特异性瘢痕。