现有资料表明，DBS手术中总体出血率大约是3%，其中引起有局灶性神经功能缺损症状的出血发生率在1%左右。术中多通道MER带来的一个问题是：是否会有潜在地增加出血并发症的风险？有作者认为多通道微电极穿刺增加出血概率的风险极小，在有报道的相关手术中出血的病例极少，不值一提。但是理论上，多通道穿刺不排除增加出血风险的可能性。目前多种方案可以用来减少相应的风险，其中最重要的就是术前计划强调针道设置的重要性，特别注意避开血管结构，尽量避开穿越脑沟。另外，避免因脑组织移位对套管针造成额外的剪切应力。术中的针道并非越多越好，通常良好分辨率的MRI，没有必要同时进行5针道的穿刺。这些，在术前计划中都应该仔细考虑。目前，有多种常用的手术计划系统软件，这些软件都能很好地配合立体定向仪，帮助功能神经外科医生做好手术计划，提高手术的准确性和安全性。