在人体与外界相通的腔道和体表寄居着大约100万亿个、一千余种微生物，其数量是人体细胞的10倍，其所编码的基因是人体自身基因数目的100～150倍。实际上正常微生物群已经成为了我们机体的一个不可分割的组成部分，可以看作为人体中的一个“器官”，人体是一个由正常微生物群和人体细胞共同组成的超级生物体（superorganism）。正常微生物群对宿主发挥着十分重要的生理功能，包括防御外来感染、促进免疫系统发育成熟和调节免疫反应、合成营养物质、参与宿主各种物质包括能量的代谢、以及增强黏膜屏障功能等。