李院士果然是说到做到，不仅给首都XX大学的校长写了信，还联合其他院士给科学院也写了信。声称这次事件不仅仅是“剽窃论文”的性质，而是“抢夺论文”，甚至上升到学术霸凌的高度。要求严肃调查这次论文事件。与此同时，新闻媒体和网络上也不知道从哪得到的消息，铺天盖地进行了报道和声讨。
事情来了一个大反转，对诸葛亮的调查组没有成立起来，直接原地变成了针对杨鹏的调查组，还加进来两个校领导担任组长。因为陈院士作为通讯作者也署了名，他也一起成为了调查对象。
就在调查组到实验室宣布启动调查的当天晚上，诸葛亮从外面回来，刚走到宿舍的楼下，只听黑影中一个人喊他：“诸葛，诸葛老师！”
诸葛亮回头一看，是杨鹏，心里没好气，问道：“你来找我干嘛？”
杨鹏犹犹豫豫走过来，说道：“方便跟你说几句话么？”
诸葛亮原地站定，“你说吧。”
杨鹏低头耷脑地说道：“这次论文的事儿，是我对不起你。想请你原谅。”
诸葛亮冷笑一声，“你有什么资格让我原谅啊？”
杨鹏说道：“我没有资格来求你原谅，但是这事儿还影响到了陈老师，他是咱们专业的顶梁柱，为咱们学校做了很多贡献，你不看僧面看佛面。”
“哦你们还很有面子啊？当学阀立山头也算是贡献？呵呵。”
“我愿意做出补偿，我可以辞去学科带头人，经费也可以给你。这件事，从头到尾都是我失去理性，我太贪婪了，嫉妒你的成绩。”
诸葛亮忍不住打断杨鹏的话，“哪件事你有过理性？你有人性么？丁琳是不是你打的？你还是个人么？”
“丁琳？”杨鹏停住了，脑子在飞快地转动，“这是她告诉你的？”
诸葛亮怒气难平，恨不得现在就取了他的性命。
杨鹏盘算了一会儿，忽然换了一副面孔，陪着个笑脸说道：“我打丁琳不对，属于一时冲动，我愿意向她道歉。还有经济补偿。”又偷眼看了一下诸葛亮的脸色，说道：“诸葛呀，算我粗心，以前没有注意到。这个......如果你对丁琳有意思的话，我愿意退出，把丁琳转让给你......”
诸葛亮飞起一脚，踹在他的肚子上。杨鹏仰天跌倒，一屁股坐在地上。诸葛亮正要上去补几下，他已经飞快地爬起来，头也不回跑掉了。
过了两天，调查组来人，通知诸葛亮把论文事件的前后经过，以及论文的所有资料整理一下，交一份书面文件。等后天调查组来当面谈话。
院里边，杨鹏和吴院长等人都不见了踪影，诸葛亮心想，这群人是不是已经没脸见人了？实验室里的同事对诸葛亮的态度已经有了明显不同，有人上来恭喜祝贺他的新论文，有人已经开始打听下一步研究没有什么可以合作的机会。
贾宇村躲在一边，心里七上八下，上一次他打小报告给杨鹏，说诸葛亮的论文还没有投稿给期刊，并且以此得到了陈院士阵营的接纳。想不到弄巧成拙，反倒提供了一条假情报。他不能确定诸葛亮是不是知道他投靠了杨鹏，想着不知还有没有机会再把自己洗白。
诸葛亮一上午都呆在实验室里，把陈院士等人找他谈话的所有内容和经过，都写成了材料，然后送到了学校纪委。之后又给李院士打了个电话，汇报了一下情况。李院士很高兴，说你做的非常好，我一定紧盯着这件事，不能让他们不了了之。
想起来股票开户的事情还没有办，诸葛亮就又坐车到附近的大河证券公司开了个户，把银行卡上仅有的十万块钱转进了股票账户。办完这些事情，已经是刘豆豆放学的时间了，就直接去关羽家去见他们。
这些天来关羽已经主动请缨，担负起接刘豆豆到他家补课的任务。刘备也乐得其成，下了班直接到关羽家就行了，和关羽俨然已经成了朋友。
诸葛亮心中琢磨，等时机差不多就可以给刘备恢复前世的记忆，股市筹钱这事儿问题也不大，万事俱备，只欠东风，希望寻找其余五把宝剑的事情，能得到一些新的线索。想到这里，不由心情大好，觉得学校里的一摊烂事简直不用放在心上。
晚上给刘豆豆上完课，告别了刘备和关羽。诸葛亮坐公交车回家，等下了车路过学校附近的小公园，就发觉有人跟踪。他紧走几步，刚转过一片小树林，迎面一条黑影扑过来，一块砖头拍在诸葛亮的脑门。
诸葛亮只觉得眼冒金星，用手一摸，满手是血。正要与这黑影撕打，突然后腰一凉，跟踪的那个人也逼了上来，一把匕首抵在了诸葛亮的腰上。
诸葛亮不敢乱动，问道：“你们要干什么？”
一人回答：“你丫老实点儿，乖乖儿听话，内边去！”用手一指小树林。听口音是老BJ。
诸葛亮被两人推着进了小树林，慢慢看清对方的长相，一个光头，一个留着小胡子，脖子上是大金链子加各种刺青，看来都是老炮儿。
“你不是想知道我们是干嘛的么？”老炮儿开口了，“我们就是受人之托，来铲事儿的。”
“铲什么事儿？”诸葛亮问道。
“就是你和杨鹏的事儿，他托我们警告你一声儿，见好儿就收。往后什么都别说，什么都别做。若是不然，今儿个是一砖头，明儿个就给你一透明窟窿。”说着话，诸葛亮只觉得腰后的匕首顶了一顶。
老炮儿说完，一脚踹在诸葛亮的腿窝子上，转眼不见了。
诸葛亮从地上爬起来，摸出电话报了警。
警察和救护车很快就来了，诸葛亮告诉警察，有两个人要杀我，我挣扎着跑出来呼救，凶手就跑了。诸葛亮被送到医院，检查之后问题不大，就是头上受伤，血流了不少。包扎之后送到观察室，怕有脑震荡，医生要求明天再走。
诸葛亮盘腿在病床上，略施法力，祭起一个蜜蜂大的【飞探】，回到他被人伏击的小花园，循着那两个老炮儿的影子，追了下去。一盏茶的功夫，【飞探】从窗户进来，诸葛亮已经知道两人家住哪里。
随后诸葛亮给关羽打了个电话，叫他来一趟医院。关羽一听吓了一跳，马上打车来到。见到诸葛亮的样子，急声问道：“军师你怎么了？”
诸葛亮示意他不要声张，叫关羽坐下，慢慢把今天的事情告诉了他。关羽听了怒不可遏，一拍桌子站起来，见诸葛亮打着手势让他息怒，又坐了下来，压低声音说，“让我去把那小子的人头砍下来，给军师出气！”
诸葛亮说道：“现在这种事情可做不得，这个世界有这个世界的规矩，有法律有警察，不像是前世那个时代了。”
关羽还不服气，争辩道：“岂能让这种鸟人骑在头上拉屎？”
诸葛亮微微一笑，说道：“那到不会，你今晚就去办一件事情。”说罢，写了一串地址交给关羽，又低声对他交代了一番，关羽点头，领命而去。
第二天，一辆警车闪着警灯开进了学校，直奔实验室。消息很快传开，是要拘捕杨鹏，他雇凶杀人，两名凶手已经投案自首。现在杨鹏不知道躲到哪里去了，正在通缉追捕之中......