海神之穴。
“按照卡露乃小姐所说的，闪焰队的总部应该就在这附近了。”艾露说道，“只是这附近根本没有什么建筑物，只有海滩和洞穴。”
“先进去洞穴看看吧，也许会有线索。”莎娜说道。
一行四人进入了洞穴，洞穴里黑乎乎的，瑟蕾娜和艾露分别召唤出各自的妖火红狐，利用它们尾巴上的火焰来照明。
一行人渐渐深入了洞穴，忽然间，瑟蕾娜指向前方，惊呼道：“你们看！”
其余三人顺着瑟蕾娜所指的方向看去，只见一个巨大的建筑正坐落在洞窟当中。
“那里应该就是闪焰队的总部了。”可尔妮说道。
四个人走上近前，只见闪焰队总部的大门牢牢关着，而周围也都是密闭的。
“出来吧，路卡利欧！”可尔妮说着，丢出精灵球，将路卡利欧召唤出来，“路卡利欧，mega进化！”
一条条光链将可尔妮和路卡利欧连接起来，完成了mega进化。
“路卡利欧，波导弹！”可尔妮说道。
Mega路卡利欧发出一枚波导弹，顿时将那大门轰开。
一行四人走进门内，只见空旷的房间内竟一个人都没有，许多门也都是紧紧关着。
Mega路卡利欧发出波导弹，将一个个门轰开，一行四人在各个房间中不断穿梭着，寻找着小智的下落。
终于，他们在一个房间中发现了被关在铁笼内，还在尽力撞击着铁笼的小智和皮卡丘。
“小智！”瑟蕾娜等人连忙跑了过来。
“瑟蕾娜！艾露！可尔妮！莎娜！”小智连向着她们挥手。
“小智，你们后退一下。”可尔妮说着，等到小智和皮卡丘后退到足够远之后，这才下令说道：“路卡利欧，骨棒乱打！”
Mega路卡利欧迅速冲上前，挥舞着骨棒接连敲打几下，将铁笼打出个巨大的窟窿，小智和皮卡丘当即从其中逃了出来。
“谢谢，可尔妮。”小智说道。
“小智，你知不知道闪焰队的人去哪里了？”艾露问道。
“我不知道。”小智将之前的经过简单地说了一遍，随后说道：“我被他们关起来之后，他们就离开了。”
“总之，先前往最近的宝可梦中心和其他人联络一下吧。”莎娜说道。
其余人纷纷点头，随后离开了闪焰队总部。
……
密阿雷市。
“事情就是这样。”史特隆说道，“所以我们才来找你们，商量下对策。”
站在史特隆和尤莉嘉面前的，是布拉塔诺博士和史特隆二人的爸爸利莫内。他们二人听到史特隆的话之后，都仔细思索起来。
忽然，尤莉嘉抬起头，指着天空说道：“你们看！”
天空中，一架架直升机飞过，向着某个方向飞去。
“科学开拓未来的时刻，史特隆特制引擎，on！”史特隆说着，背包的机械臂就从背包中掏出一个望远镜般的机器，“这是事先预料到这种情况而发明的伟大机器，超远距离望远镜！”
“说白了还是望远镜啊……”尤莉嘉叹道。
史特隆拿着那望远镜向空中望去，说道：“糟糕了！”
“怎么了？”利莫内问道。
“在那些直升机里坐的都是闪焰队队员！”史特隆说道。
“看他们飞的这个方向，目标似乎是……百刻市！”布拉塔诺博士说道。
“走，我们也马上过去。”利莫内说着跑向店里，同时挥了挥手示意其他人跟上去。
其他人看到他的示意，也连忙跟上。
一行人来到店里，只见利莫内从仓库中开出来一辆大型跑车，说道：“你们赶紧上来！”
三个人连忙上了跑车，随后利莫内开着跑车，在密阿雷市的街道上迅速疾驰着，向百刻市开去。
……
百刻市，百刻道馆内，葛吉花正在闭目调息着，一雌一雄两只超能妙喵正在她的左右两侧站着。
忽然，葛吉花睁开双眼，与两只超能妙喵同时施展超能力浮上了空中。
在百刻道馆内的几名训练家都有些惊讶，不过并未出口打扰。
葛吉花的双目中发出光芒，在她的正前方形成一幅绿色的图像，图像不断变化着，同时葛吉花的面色也渐渐阴沉下来。
“你们去转告一下卡洛斯联盟。”葛吉花开口说道，“闪焰队已经重新复活了，他们将要来到这百刻市，利用那日晷来毁灭卡洛斯地区。一旦他们成功，后果将不堪设想。”
“是。”几名训练家应声退下，纷纷去转告卡洛斯联盟的各个高层人员了。
“为什么预言中还有一些不确定的因素……”葛吉花自言自语着，“似乎不是和闪焰队有关，而是有着更大的危机……”
……
城都地区，白银山，某处遗迹之外，坂木正站在这里，身旁还有着几名火箭队的队员。在距离他们不远处，正有几名被绳子绑住、嘴里还塞着纸团并不断挣扎的考古人员。
“这里就是未知图腾的栖息地吗……”板木说着，走了进去，而几名火箭队的队员却没有跟上去，而是守在外面。
遗迹之内是一条长长的通道，坂木向着里面走去，两侧的墙壁上刻满了符号，形状都与未知图腾非常相似。
“传闻中，未知图腾一共有二十八种形态，当两只以上的未知图腾聚集在一起，就会拥有不可思议的力量。”坂木思索着，“未知图腾具有读取人心并将之实体化的能力。只要运用得当，我就可以利用未知图腾的这种力量，进而帮助我得到阿尔宙斯所分出的那股最初始的力量……”
就在这时，两侧墙壁的符文上，一个又一个未知图腾从中出现，随后围绕着坂木旋转起来。
“未知图腾啊……聆听我的声音吧……让你们的力量为我所用吧……”坂木冷笑着，双臂高举，顿时周围的未知图腾身上都发起了光。
一只只未知图腾分成了几层，每一层的未知图腾都绕成了一个圈，每一层和旁边那一层旋转的方向都不一样，分别以顺时针和逆时针的方向交错旋转起来。
坂木的身上发起了光，随后飞了起来。
“这就是未知图腾的力量吗……”坂木哈哈大笑了起来，随后手指着远方，“未知图腾啊，带我到卡洛斯地区去吧！”
一只只未知图腾绕成双螺旋形的结构飞向了远方，坂木跟在后方，向着卡洛斯地区飞去。
……
关都地区的某处平原，亚希达正行走着，忽然，他停了下来，望向远方的天空。
“总觉得有某种不详的预感。”亚希达皱了皱眉头，随后拍了拍手，说道：“基拉祈，出来吧！”
只见周围的空间光芒一闪，顿时基拉祈就出现在了亚希达的身旁。
“基拉祈，拜托你再次运用你那实现愿望的能力，探查一下危机的源头吧。”亚希达面色凝重地说道。
基拉祈眯上双眼，接着，基拉祈的身后突然出现一幅画面，上面正是被未知图腾包围着的坂木。
“是他？”亚希达似乎有些惊讶，但还不待他开口说些什么，只见那画面再度变化，露出了卡洛斯地区的画面。
“看来，一切都要在卡洛斯地区做个了结了。”亚希达说道，“走吧，基拉祈。”
说着，亚希达竟然就凭空飞了起来，带着基拉祈向着卡洛斯地区飞去。