在前面的章节中我们已经看到，基于文化框架的认知与个体的或小集体的认知，不论是在性质还是在规模和作用范围等方面，都有着显著的差异。但是尽管如此，它们两者在某些形式和机制方面，又存在惊人的相似性！这既是大千世界奇妙性之使然，也是复杂现象背后的简单性之使然。如果我们能从本体论、方法论的角度弄清这一点，对于我们充分认识文化认知现象是大有裨益的。为此，本着“工欲善其事，必先利其器”的想法，在充分的研究展开之前，有必要再从相似的角度先讨论一下一般方法特别是类比研究方法及其本体论基础诸议题。首先，我将从“精神胚胎学”有关相似性的论述出发，结合皮亚杰关于儿童认知发展与人类科学思想之间相互平行的研究成果，着重从发生学的角度探讨人类个体（心理、意识）与人类种系（思想、精神）之间的相似性、同构性、重演性等特性，以说明类比性研究、相似性分析在科学哲学研究中的作用及其范围。并在此基础上，从本体论和方法论的高度分析和回答自然界为什么在不同的层级或层面上呈现出广泛的相似性，系统二分、对偶是否是大千世界的基本构型，不对称性是否比对称性更为基本，为什么从相似性中能够发现事物之间的本质联系，类比、隐喻等能够成为与实验方法和数学方法并驾齐驱的科学方法吗等问题，以便为进一步的探讨提供方法论的“利器”。