中药资源学基础理论综合了资源经济学、资源物理学、资源生态学等相关理论和方法，与中药资源交叉融合，形成了学科特色明显的中药资源学基础理论体系。本章节重点介绍了中药资源调查基本理论，如种群的概念、中药资源生物多样性、中药资源与环境等；中药资源保护的基础理论，如保护生物学、物种濒危灭绝机理、中药资源濒危机制、中药资源的可持续利用理论等；中药资源分布及生产区划相关理论，如道地药材理论、环境适应理论、地域分异规律等；中药资源市场相关理论，如微观经济学、资源经济学、福利经济学等内容。中药资源学基础理论进一步规范了中药资源学的学科理论体系，凸显该学科的系统性、科学性和实用性的特点。