虽然医疗保健组织已经将信息系统应用于管理流程，但用于患者护理和质量改进系统的灵活性不足。信息系统必须允许获取的患者结构化数据、医疗保健干预措施和成果作为日常护理过程的一部分；必须提供决策辅助，例如当临床医生做决策时，采用提醒、警示和提示等；必须依据指南和规则，促进涉及多个设施中的多个规则的协调护理。除了向个人提供照顾护理和改善循证临床实践（改善群体医疗），医生和医疗保健领导者有责任倡导和推动医疗环境变化，实现大范围、持久的改善。采用激励、教育和信息技术支持质量改善，公众可以期待医疗体系整体效能巨大的、可衡量的改进。

大多数医疗机构拥有管理和临床信息系统。管理系统包括门诊管理、住院患者入院/出院/转院系统，以及预约、登记、获取收费信息、患者费用及索赔管理等。附加的管理系统可能包括财会、预算、成本核算、物资管理及人力管理。临床系统包括用于临床科室的实验室、放射学及心脏病学等。这些系统可以录入请购单、跟踪完成测试，并获得结果。

医学信息系统应支持以下高级功能：

（1）医生可访问患者信息，如诊断、过敏、实验室结果及药物治疗；

（2）可访问多个医疗机构最新以及过去的检测结果；

（3）计算机输入；

（4）计算机决策，以避免药物相互作用及更好遵守实践；

（5）信息提供者和患者之间安全的电子沟通；

（6）患者可查询健康档案、疾病管理工具及健康信息资源；

（7）计算机化管理系统，如调度系统；

（8）基于标准的电子数据存储，疾病监测等。

一些医疗机构通过开发数据存储库扩充管理和临床系统。分析数据存储、相关数据分析及报告应用程序等采用从管理系统获得的数据，并使其可用于常规和临时报告和研究。这些系统有多种名称：决策支持系统、数据仓库、数据存储、执行信息系统和商业智能系统。这些系统包括用于统计分析的方法，如：风险和严重度校正、图形分析和统计建模。在医疗服务过程中，需要更加重视录入数据库的数据质量，包括：编码程序和诊断的一致性、利用患者识别设备或概率匹配算法以正确匹配同一患者数据。

一小部分医疗机构已经实施临床数据存储数据库，他们从不同临床辅助系统中获得数据，储存在数据库中，并通过临床医生的上游应用程序使信息可以被访问。这些系统被称为临床医生工作站、电子病历、计算机化病例和患者终身化病例。除了显示结果数据，应用程序还可以维护患者个人资料，包括医疗问题清单、用药清单、药物过敏、家族和社会史、威胁健康因素（如吸烟、血压和体重）。该存储库也可包括临床待办事宜清单、安全临床信息及网络医疗参考，如内部实践指南、医院会健康计划处方、MEDLINE上的科技论文、医师案头参考和医学教科书合集。

工作流系统一般具有工作流程说明数据，包括：描述工作过程中任务或活动顺序、在执行每个任务所需的资源以及管理或执行每项任务所需要数据。工作流系统一般还包括管理单个工作流的执行，诸如工作流跟踪单个医嘱的执行。该组件是所谓的工作流引擎，一个工作流自动化服务器，或者一个工作流执行服务器。它能够跟踪每个工作流的状态决定下一步需要执行哪个任务和执行任务所需人力或系统资源，以及传输所需要数据。在这些系统中，电脑化形式的完成提供启动工作流所需要的数据。

工作流系统提高服务效率，因为他们能够在正确时间向正确的人或机器提供正确服务；提高服务的一致性和质量，因为根据定义最佳实践的工作流程说明，可以跟踪工作；提高服务可靠性，因为系统可以识别和管理错误。一些工作流系统还可以提供一个可以适应多种服务的通用框架流程。

在医疗保健方面，工作流程自动化整合信息技术和服务，使它们可用于治疗过程。这些服务包括：调查；出站记录的电话、电子邮件及传真；印刷及邮寄通用或定制的教材；电子寻呼机或短信；以及第三方远程监护、护理管理和疾病管理。临床工作流系统也可以为保险资格和预授交易，以及配套部门系统的订单和订单状态的检查提供一个接口。

工作流程自动化技术通过连续照护提高团队合作，包括不同地点的临床医生、住院设施、配套服务供应商、家庭医疗保健、呼叫中心和其他设置。它承诺协调护理随着时间的推移，确保后续需要的检测或治疗；确保了医疗保健干预措施的顺序发生与根据预定临床方案或照顾图示保持一致；使临床医生负责过程改进，因为它提供修改工作流程规范的工具，无须改动软件。其结果是，医生能做一个关于临床过程变化和实施变化的决策，无需编写方案、资金资助以及等到变化达到程序员优先级列表顶部。在护理过程中，哪怕是很小的变化都需要令人沮丧的资本和信息技术发展流程，临床医生往往采取非信息技术方法实现改变。他们使用的纸张、橡皮图章、印刷指南、贴在墙壁上的标识、白板上的图标以及其他技术含量低的替代品。这些方法在短期内是有效的，但随着时间推移及地点变化，会导致医疗差错。通过减少可扩展性压力、耐用过程变化，临床工作流程自动化技术有望成为用于减少医疗差错和提高临床工作的效率和质量的一个强大工具。

模板图表是高级临床医生工作站的一项重要特征及结构。模板图表是临床医生获取结构化或非结构化数据的单一过程，可提供医疗记录文件，同时支持其他数据需求，如计费、研究、测量质量和结果。模板制图应用程序也被称为临床文档、笔记及制图程序。该程序允许医生利用之前准备好的模板更加高效的书写材料，然后根据不同患者进行修改。模板不仅可加快记录过程，还能提醒医生数据应包括的条目，使记录更加完整和标准化。这些记录利于患者治疗，同时，计算机可读、可分析的数据可用于订单、请购单、转诊、处方和计费。

（1）更完整的文档支持更高水平的管理代码，会带来更多利益。

（2）更加完整的结构化文档可以为临床警示、提醒等提供数据支持。例如通过文档记录的用药史、药物过敏、体质等，系统可以分析添加到患者治疗计划中的一种新药，是否会与目前正服用的药物相互作用、是否过敏、是否不适合患者体质、是否其他药物更实惠，或更符合医院或健康处方。

（3）更完整的结构化数据可用于支持临床研究、质量保证和结果检测，确保循证临床过程改进。

如上所述，模板制图程序用于记录结构化和非结构化数据。非结构化数据包括将手写记录通过影像或语音设备录入患者电子记录。非结构化数据也可采用临床图表格式，如图示肺部肿块切除部位或是显示腹部疼痛分布。结构化数据作为数字或代码被电脑识别，包括程序代码、识别代码、生命体征和许多生理指标（如关节运动、视力范围）、从患者或医生处收集的结果调查数据。

医院信息系统在国际学术界已经被公认为是新兴的医学信息学的一个重要分支。随着新医改的逐步推进，由路径知识库、临床路径执行平台、质控管理平台、绩效平台以医疗软件为基础建立的临床路径系统，将以电子病历系统为依托，与其他医疗信息系统相互融合，转变常规诊疗模式，规范医生诊疗活动，不断持续的改进医疗质量。医院信息化系统只是一个统称，本质是将医院各科室的系统进行整合，使其互联互通，共同织成一张能够覆盖整个医院的信息大网。通过系统间的信息共享，避免了信息孤岛，方便其他科室进行信息调用，提高了医院整体管理水平和工作效率，不仅优化了流程还减少了人为的误操作，有效地提升了医院服务质量和患者满意度。随着中国新医改的推进，医疗卫生行业正受到前所未有的重视，医疗信息化建设逐渐成为信息技术市场的热点之一。实现以人为本的医疗服务体系，是新医改方案明确提出的目标。