话说张钧向灵帝发出指控，认为如今导致天下大乱的主要缘由都是在于中常侍放纵亲属人员胡作非为的缘故，因而只要将中常侍各人都斩杀并敬告天下，则盗贼自然伏法，乱势自然可平。原本张钧所指的只是十常侍等一些人，虽然这个事情惊吓到了赵忠张让等人，但由于缺乏实质的据证，且又让灵帝一时想起了吕强的事例，所以这就引得灵帝顿时间大发雷霆，怒责张钧说话真是不经脑袋思考，难道所有中常侍都不是好人吗；于是张钧便被下令逮捕，暂时关到监狱里去反省。然而就在张钧被关押期间，御史却得到授意说是灵帝有意要处理张钧，于是立时搜罗了所谓证据指控张钧本身也是黄巾教徒，并出示了相关罪证，然后张钧就被论罪处死了。
就在灵帝这方因为这些事情而烦心时，下方突然传来战报，说是南阳太守褚贡在与黄巾渠帅张曼成所部的交战过程中战败被杀，宛城被张曼成攻克，南阳郡界已被黄巾军基本全面占据。灵帝一得知这个消息不由立时紧张了起来，就赶忙召集杨赐前来询问当前的战局状况如何，然而杨赐的回答却是目前的形势有些不大理想，由于对方人多势众，且战事突发，关东各州郡长官没能预先做好相应的防备工作，因而有被全面攻克占领的风险。对于杨赐这直观的回答，灵帝感到很是不大高兴，原本该做的事情都做了，该用的人也都用了，该出的经费也都出了，却还是不能起到有效的作用，总不能真的是老天爷要让大汉灭亡在他的手里吧，这显然不是他所能够接受的。
原本灵帝以为当前的情况已经够糟糕了，却没想到还有更糟糕的，便是在颍川一带与波才军交战的朱儁在首场的交战中落败，然后汝南黄巾在召陵郡内打败太守赵谦，以及广阳一带黄巾军打败并杀死幽州刺史郭勋及广阳太守刘卫两人等。得知这些负面战报后灵帝不由顿时大怒不已，但又突然疑虑起这会不会是因由吕强的死而影响到了这一派人马的军心和士气，而就在灵帝满面阴晴不定的时候，那个杨赐忽然表示自己的任职已经到期，且目前也派不上什么实际的用场，所以恳请灵帝更换其它高才来担任太尉一职，并向灵帝举荐了太仆邓盛以及大司农张温两人。于是，灵帝便更换了邓盛来担任太尉的职属，由张温来担任司空的职属，并没有明确向二人收取任何的入职费用，毕竟眼下这个关头收不收取任何入职费已经没有了任何意义，而尤其是一旦立下功勋，就基本可以抵消这个入职所需的费用了。
就在灵帝一筹莫展的时候，邓盛忽然提议让议郎曹操担任武职，然后带兵先南下去帮助皇甫嵩与朱儁两人讨伐颍川一带的黄巾军，如果可以攻克，再分兵向别处去征讨其它郡县的黄巾军。灵帝观察了一下地图上的形势，觉得颍川一带的黄巾军是距离京师最近的黄巾教众之一，从这里开始讨伐起倒也是一个比较合适的落手点，而唯一的问题就在于曹操本身有没有带兵征战的能力，而为了确定这一点，灵帝便召见曹操来向其询问一些有关军事上的计略问题。
对于当前的战事问题，曹操以为按眼下的形势来看还并不明朗，各地的黄巾教徒还尚在兵峰正盛的势头上，因其悍不畏死勇于冲战，所以在正面交战之时因人数上的劣势对于朝廷军一方而言会有所不利；但尽管正面交锋中各地军马还不能即时对其取胜，但若能因地制宜施以奇谋计略，则按时机来获取胜利也未尝不能得其所愿。对于曹操的这一番分析让灵帝觉得其还是有一些军事才能的，因而就任命其为羽林骑都尉，率左右羽林骑士共两千人，前往颍川支援皇甫嵩朱儁二部围剿黄巾军。
话说农民起义军干事是十分不易的，或者说即使一开始能够势起，但缺乏足够的专业才干而往往使其不能长久持续下去。因而虽然眼下的形势看着还挺风风火火，等到势头一过，气势衰弱，之后可能就要出问题了。
然后等曹操赶到了地方，还没有正式参与交战的时候，那黄巾军就被皇甫嵩给干败了，然后靠的主要是火攻之计。于是趁着黄巾军阵势大乱四处奔逃的空当，曹操带着手下队伍开始趁势捡漏，而后战况发展到结尾即由朝廷军这方获取了本场战斗的大胜。而这一次黄巾军被斩杀了数万人，且因为破敌的计策主要是皇甫嵩想到的，所以灵帝主要累计了皇甫嵩的功劳封了他一个都乡侯的爵位。
之后皇甫嵩、朱儁及曹操所部又趁势进军，同豫州刺史王允汇合于治所阳翟，并在此处击破打败了波才其部，然后又继续进军陈国，在西华击败了汝南黄巾部的渠帅彭脱。然后黄巾军剩余残部退出了豫州境内，前往荆州南阳方向与张曼成所部进行合流，于是豫州境内的黄巾叛乱之势暂且得以平定。而这时灵帝准备要再奖励皇甫嵩，但皇甫嵩却将功劳都归到了朱儁的身上，灵帝封朱儁为西乡侯，并迁升为镇贼中郎将，并下令让皇甫嵩北上兖州去讨伐东郡一带的黄巾军，让朱儁南下去讨伐南阳的张曼成，至于曹操则令其随皇甫嵩北上继续讨伐兖州境内的黄巾军。
话说卢植此时在巨鹿郡内与张角交战，连续交战了几次才打败张角，然后张角损失了上万多人便退守于广宗城内闭门不出。而后卢植进逼，但暂无办法可以攻克广宗，所以只能先筑造攻城器械，再寻找合适的契机发动进攻。而碰巧灵帝这时派遣了小黄门左丰前来视察战况，认为卢植的做法有点像是在消极怠战，所以就打算将这个事情汇集一下上报给灵帝知晓；原本这时有人提议让卢植去贿赂一下那个左丰，但卢植并没有什么贵重的财物，所以就没有去做这个事情；然后左丰便将自己汇集到的情况上报给了灵帝知晓，对此灵帝感到有些恼怒，就立时命人前去将卢植给收押监禁了起来，并随后押回京师进行受审。
而当灵帝下完这个命令以后，才忽然地冷静了下来，一旦将卢植给撤换掉，那么下一步又该换谁来替代赴任才好。于是，这个时候那小黄门蹇硕便适时向其提出建议，可以调派前河东太守董卓来代替卢植。随即，灵帝便任命董卓为东中郎将，代替卢植前往继续进行征讨张角的工作。
然而，当董卓赴任以后，在率众对张角发动进攻的时候，却被张角分出张宝与张梁两支队伍从侧面对其进行夹攻；于是董卓无法敌住对方那数量众多的黄巾军，尤其是张梁及其所部的黄巾战士作战十分骁勇，且人数上也多出他许多，一时不利之下便只好暂时撤退返回大营。之后董卓又带人连续挑战了几次，都无法由正面将对方击破，且缕缕被对方凭借人数众多给分兵包抄，而侥幸还有另外的人碰巧率队赶来帮忙，才一时间化险为夷。
而眼见形势于己不利，董卓便忽然想起了是否可以找吕布带队前来助战。于是他在稍稍琢磨了一下后，便立时派使者带着自己的书信前往并州寻找吕布邀其前来，然后他估摸这一来一回大概只须半月左右即应足够，而后他只需要在此期间稍作等待即可。